自一九九七年起,香港紅十字會輸血服務中心開始尋求ISO9002質量管理體系認證,以確保本中心能提供高療效血液製品及高效率服務,媲美世界各地先進國家的水平。中心於一九九九年三月取得成功認證。在血液收集、檢測、成份處理、儲存及分發流程導入ISO9002質量管理體系,同時亦成為在亞洲太平洋區首間榮獲ISO9002:1994證書的血液中心。
在二零零二年,中心完成ISO9001:2000質量管理標準提升版換證工作,再進一步通過澳洲醫療藥品管理局(TGA)之「良好生產規範–人類血液及組織」(cGMP)認可審核。同年,中心榮獲亞洲醫療機構管理獎的特別獎項[Asian Hospital Management Award (the Special Award category)]。
中心分別於二零零九年二月及二零一八年五月相繼通過換證審核,獲取ISO9001:2008及ISO9001:2015質量管理體系證書。